通常，合伙企业的股权分配是按照出资比例分配100%的股权。如果出资额相同，则平分。不同之处在于，谁贡献的股份多，谁的股份就多。
如果有技术份额或专利份额，则需要将技术转化为资金，然后再分配。例如，如果三个人合伙投资相同的投资，那么每个人持有 33.3% 的股份，如果其中一个人投资技术，则有几种选择可以采用。比如投资还是一样，但是人的技术会转换成股份。比如他会变成40%，另外两个就是30%。
另一种解决方案是，拥有这项技术的人直接将技术按照价值兑换成现金，相当于他的那部分资金，然后另外两个人再多赚一些资金等等。分配的形式受制于大家的谈判。这是由于具体情况不同入股投资比例按什么算，所以没有一刀切的。
初步股权分配协商后，需要确定增资、退出等股权变更协议，比如未来生意好，另外两个合伙人想买这个科技股东的股份，怎么定价，以后生意不好。，有人要退出，股权折扣等等，这些最好一开始就写在纸上，以免以后麻烦。
所有这些都同意之后，必须在合同上用黑白书写，由所有股东签名，并且几个股东有几份副本。一旦收到帐户，就无法继续进行。
如果条件允许，比较稳妥的方法是去公证处对多方合同进行公证，以免日后合作不愉快时因合同问题引发纠纷。
